安徽醫科大學前身是1926年始創于上海的東南醫科大學，2019年獲批安徽省“三全育人”綜合改革試點高校和全省黨建工作示范高校，2022年入選教育部高水平公共衛生學院建設高校名單。學校是安徽省辦學歷史最早的高等學校之一，是安徽省第一所高等醫科院校，是安徽省屬重點大學，是教育部、國家衛生健康委和安徽省人民政府共建高校，是安徽省第一批地方特色高水平大學和第一批綜合改革試點學校，也是安徽省醫學教育中心、醫學研究中心和醫療衛生服務中心。

學校現有梅山路、翡翠路、東校區和新醫科中心校區，擁有研究生學院、基礎醫學院、公共衛生學院、口腔醫學院、衛生管理學院、藥學院、護理學院、馬克思主義學院、生命科學學院、生物醫學工程學院、第一臨床醫學院、第二臨床醫學院、巢湖臨床醫學院、國際教育學院、人文醫學學院、繼續教育學院、第五臨床醫學院、精神衛生與心理科學學院、法學院、臨床藥理研究所等直屬教學機構。擁有第一附屬醫院、第二附屬醫院、附屬口腔醫院、附屬巢湖醫院、附屬阜陽醫院等直屬附屬醫院，另有安徽省公共衛生臨床中心（安徽省傳染病醫院、第一附屬醫院北區）和多所共建附屬醫院、非直屬附屬醫院、醫學中心、附屬疾病預防控制中心，醫聯體合作單位300余家，構建起覆蓋全省、輻射周邊、貫穿“全生命周期”的安醫系健康服務體系。

學校醫學及相關學科門類齊全，已形成學士、碩士、博士完整的教育培養體系。設有覆蓋醫學、理學、管理學、工學、法學、教育學等學科門類的數十個專業，其中有基礎醫學、臨床醫學、公共衛生與預防醫學、藥學博士學位授權一級學科，馬克思主義理論、心理學、生物學、基礎醫學、臨床醫學、口腔醫學、公共衛生與預防醫學、中西醫結合、藥學、中藥學、特種醫學、護理學、公共管理等碩士學位授權一級學科，臨床醫學、公共衛生博士專業學位授權類別，臨床醫學、口腔醫學、公共衛生、藥學、中藥學、護理、醫學技術、電子信息、應用心理、法律等碩士專業學位授權類別。建有藥學、臨床醫學、公共衛生與預防醫學、基礎醫學博士后科研流動站。藥學、公共衛生與預防醫學、臨床醫學、生物學、基礎醫學等學科獲批安徽省高等學校高峰學科。護理學、生物醫學工程、心理與腦科學獲批安徽省高峰培育學科立項建設。臨床醫學、藥理學與毒理學、分子生物學與遺傳學、生物與生物化學、免疫學、神經科學與行為學、環境科學與生態學、社會科學總論、精神病學與心理學、材料科學、化學、微生物學等學科進入ESI全球排名前1%。

學校是全國科普教育基地、全國首批學校急救教育省域培訓基地和全國高校綜合性教育實踐體驗基地。學校先后通過教育部本科教育水平評估和審核性評估，口腔醫學、臨床醫學、臨床藥學、護理學、藥學等專業通過教育部專業認證，獲得多項國家級教學成果二等獎、全國教材建設獎。

安徽醫科大學的前身是1926年5月由郭琦元、湯蠡舟等在原亞東醫大的校址上（上海市滬軍營）創辦的私立東南醫科大學。

1927年秋，校董會修訂章程，改辦大學五年制，?？萍赐Ｖ拐猩?。

1928年春，杭州廣濟、蘇州醫大和廣州中法3所醫學院先后改組或停辦，大批失學學生流入東南醫大。

1930年春，學校改稱東南醫學院，并于1931年奉國民政府教育部訓令核準立案。

1931年春，時值上海南洋醫學院停辦，轉學來校者二百余，統計學生數達五百以上。院本部遷至上海真如鎮，原校址改作附屬醫院。

1937年淞滬會戰爆發，日軍入侵，校舍盡毀，師生員工擠往在淪陷后的租界——上海薩坡賽路299號院內。

上海東南醫學院院長郭琦元因擔任中國紅十字會救護總署負責人隨軍南下，學校瀕于解體。在此關鍵時刻，眾推眼科專家張錫祺教授出任院長，聘請病理學專家葉曙任教務長，他們依靠部分教授及上海、青島等地校友，籌集資金，重建校舍，張錫祺還以自辦的上海光華眼科醫院營業收入貼補辦學經費，使學校在條件十分艱難的情況下，得以續辦?？谷諔馉巹倮?，學校遷至上海南市制造局路。

1949年上海解放后，東南醫學院響應中共中央華東局發出的“面向農村、面向內地”的號召，在湯蠡舟院長的率領下，于當年12月底整體內遷安徽懷遠縣西門崗，以原美國教會辦的淮西中學、培德女子學校、民望醫院、民康醫院及省立中學等處房舍為校址，占地300多畝，成為安徽省第一所高等醫科院校。

1951年6月22日，華東軍政委員會衛生部批準將學校由私立改為國立，委托皖北行署正式接管，學校直屬中央衛生部領導。8月27日，東南醫學院附屬醫院從皖北懷遠遷至合肥市前大街（現長江路）。

1952年，學校全部遷建合肥。當年10月，經安徽人民政府批準，東南醫學院改名為安徽醫學院。

1956年，經衛生部、教育部批準，學校開始招收研究生。

1968年，由于“文革”的影響，學校遷到鳳臺縣農村，停止招生4年，第一附院停辦，第二附院被部隊占用，附院皖西分院也被國防工辦接管，大批教職醫護員工下放，人員流散，校舍、設備損失嚴重。

1970年春，學校遷回合肥。經省革命委員會決定，蚌埠醫學院、安徽中醫學院、蕪湖醫專撤并到安徽醫學院，稱“安徽醫學院總?！?，下設蚌埠、蕪湖兩分校，開始招收工農兵學員，學制三年。

1973年，省委、省革命委員會決定取消“安徽醫學院總?！苯ㄖ疲謴桶霾横t學院，籌建皖南醫學院。

1975年，學校新建衛生系，設衛生專業；同年，部隊歸還第二附院。

1976年，省委、省革命委員會決定恢復安徽中醫學院，中醫、藥學兩個系連同第二附院劃給中醫學院，安醫只保留醫療、衛生兩個系，1所附院。

1978年，安徽醫學院被定為省屬重點大學。

1985年12月，根據安徽省醫學教育事業的布局，省委省政府批準安徽醫學院改名為安徽醫科大學。

1990年，經國務院學位委員會批準為博士學位授權單位，成為第一個具有博士學位授予權的省屬高校。

1996年6月，經國家教委批準，更名為安徽醫科大學。

1998年，經教育部批準，可以招生港澳臺研究生。

2003年10月，成立研究生學院（前身是1997年3月成立的研究生部）。

2010年，入選國家“特色重點學科項目”建設高校。

2011年底，入選國家建設高水平大學公派研究生項目。

2012年，入選國家“中西部高?；A能力建設工程”（一期）。同年11月，入選教育部衛生部第一批“卓越醫生教育培養計劃”試點高校。

2013年1月，入選國家級大學生創新創業訓練計劃實施高校。5月，入選第一批臨床醫學碩士專業學位研究生培養模式改革試點高校。

2014年，入選安徽省第一批地方特色高水平大學。

2017年1月，經省編辦批準，安徽省轉化醫學研究院正式落戶學校。

2019年，獲批安徽省“三全育人”綜合改革試點高校和全省黨建工作示范高校。

2021年，安徽醫科大學（黃梅戲）入選2022—2024年度安徽省非物質文化遺產傳承基地名單。同年10月，與安徽省藥品監督管理局簽約合作共建“安徽省藥品監管科學研究中心”。

2022年，入選教育部高水平公共衛生學院建設高校名單。同年3月，成為“一帶一路”熱帶醫學聯盟常務理事單位。同年4月，安徽醫科大學新醫科中心（新校區）項目獲批向社會公布。

2024年1月，安徽醫科大學附屬馬鞍山市疾病預防控制中心揭牌。3月，安徽醫科大學附屬六安市疾病預防控制中心揭牌 。10月，安徽醫科大學新醫科中心（新校區）順利啟用。

以上信息源自官網，數據截止至2025年6月，請以官網為準！