HPA人類蛋白質圖譜

基本介紹

2003年完成的人類基因組計劃成功地對所有20,000個蛋白質編碼基因（蛋白質組）進行了測序，這是一項巨大的科學成就，但這實際上只是一個開始。下一步是檢查蛋白質組以開始了解所有這些蛋白質的功能。

人類蛋白質圖譜(HPA)項目于2003年啟動，目標是使用基于抗體的蛋白質組學系統地繪制這些蛋白質的表達。該計劃主要設在瑞典，由非營利組織Knut和Alice Wallenberg基金會(KAW)資助。內部生產和商業購買的抗體首先由研究人員驗證，然后用于表征每種蛋白質。

數據可通過開放式交互式數據庫獲?。簑ww.proteinatlas.org.

它包含數百萬張高分辨率圖像，顯示44種不同正常人體組織(Tissue Atlas)和20種不同癌癥類型(Cancer Atlas)中76 種不同細胞類型的蛋白質表達的空間定位。

在美國細胞生物學學會（ASCB，2016年12月）上，一個新的Cell Atlas在HPA的更新版本（第16版）中發布，參加人數眾多。

特色功能

它的特點：

l 免疫熒光染色細胞的高分辨率、多色圖像

l 代表人體不同器官細胞群的56種細胞系中蛋白質的亞細胞空間定位

l 使用深度RNA測序表征的所有人類基因的mRNA表達

l > 12,000個基因和可用抗體映射到30種不同的細胞結構（即細胞核、胞質溶膠、線粒體等）

精確定位蛋白質的亞細胞定位對于理解其功能至關重要。當它們定位到預期的微環境（即細胞器、囊泡或大分子復合物）時，它們將在合適的生化條件下遇到其他蛋白質或RNA以實現其分子功能（Breckles，2016）。這份全面的圖譜為世界各地的研究人員對蛋白質功能進行更復雜的研究提供了急需的工具。

以下是Cell Atlas中的一些示例圖像：

CCNB1：細胞周期蛋白B1是一種調節蛋白，位于細胞質中，參與人和小鼠細胞的有絲分裂。它主要在細胞周期的G2/M 期以細胞周期依賴性的方式表達。在圖中，U-2 OS人細胞系中的細胞周期蛋白B1蛋白表達（抗體HPA030741）以綠色顯示，而細胞核為藍色，微管為紅色。

蛋白質圖譜

DAXX：死亡域相關蛋白6是一種多功能蛋白，主要定位于人和小鼠細胞的細胞核和核體，但也在細胞質中表達。DAXX 與有絲分裂G2期的著絲粒相關。在細胞質中，它通過與細胞凋亡抗原Fas相互作用來調節細胞凋亡。該圖顯示了細胞系A-431中細胞核內的核體（GFP標記的抗體HPA008797）中的表達。