臺北醫(yī)學(xué)大學(xué)原名臺北醫(yī)學(xué)院，創(chuàng)立于1960年6月1日，是醫(yī)學(xué)專家暨熱心醫(yī)藥教育人士胡水旺先生與徐千田先生等所捐資創(chuàng)設(shè)。創(chuàng)校之初，校地盡是一片荒蕪水田，教學(xué)與研究資源匱乏，四十八年來，在歷屆校長的努力下，從創(chuàng)校之三學(xué)系二專科，擴展為現(xiàn)有醫(yī)學(xué)院、口腔醫(yī)學(xué)院、藥學(xué)院、護理學(xué)院、公共衛(wèi)生暨營養(yǎng)學(xué)院五個學(xué)院，十三學(xué)系及十三研究所之規(guī)模。自從2000年改名臺北醫(yī)學(xué)大學(xué)以來，便一直以成為國際一流醫(yī)學(xué)大學(xué)為目標，持續(xù)努力。

在教學(xué)方面，作為一所都會型醫(yī)學(xué)專業(yè)大學(xué)，臺北醫(yī)學(xué)大學(xué)的教育理念，在于教導(dǎo)學(xué)生醫(yī)學(xué)專業(yè)知識之外，同時重視博雅教育，回歸以人為本的教學(xué)。在這樣的理念上，自2006年起，連續(xù)三年獲得教育部教學(xué)卓越計劃補助，獲得肯定。為落實該校結(jié)合醫(yī)學(xué)科技與人文教育的理想，深化人文與通識教育，學(xué)校以專業(yè)教育通識化、通識教育專業(yè)化為兩大主軸，持續(xù)貫徹教學(xué)品質(zhì)與績效的目標。

在研究方面，頂尖研究是國際一流大學(xué)不可或缺之一環(huán)，臺北醫(yī)學(xué)大學(xué)過去幾年來，研究水準已有長足的進步。為持續(xù)朝向世界前五百大頂尖大學(xué)，學(xué)校順應(yīng)國際趨勢，極力爭取大型及整合型研究計劃，延攬國內(nèi)外杰出人才及其團隊，提高研究獎勵，并建立與國際一流研究單位合作關(guān)系。

在醫(yī)療方面，隨著教學(xué)研究的成長，該校醫(yī)療體系也日漸茁壯。臺北醫(yī)學(xué)大學(xué)擁有附設(shè)醫(yī)院、萬芳醫(yī)院、雙和醫(yī)院，三所附屬醫(yī)院，近三千床之規(guī)模，是為臺北地區(qū)醫(yī)學(xué)院校最大之醫(yī)療體系。臺北醫(yī)學(xué)大學(xué)統(tǒng)合學(xué)校及三附屬醫(yī)院的資源，在見、實習(xí)與臨床技能訓(xùn)練上，具有完整的設(shè)備與空間，更以服務(wù)鄰近社區(qū)，保障國人健康為職志。

洪奇昌：民主進步黨立法委員

林益世：國民黨立法委員

侯文詠：麻醉醫(yī)師、知名作家

張洪量：牙醫(yī)系畢業(yè)，流行音樂歌手、制作人

隆中隱：知名中國音樂教育者

陳以生：牙醫(yī)系學(xué)士、口研所碩士，流行音樂歌手

陳子忠：醫(yī)技系學(xué)士、中港臺醫(yī)療管理人員

李良雄：臺北榮民總醫(yī)院院長

1958年，創(chuàng)辦人胡水旺先生、徐千田先生籌設(shè)北醫(yī)。

1960年，北醫(yī)創(chuàng)立，當時有醫(yī)學(xué)系、牙醫(yī)學(xué)系及藥學(xué)系三系。

1963年，成立護理助產(chǎn)專修科，招收五專生。

1965年，成立醫(yī)事技術(shù)專修科，招收五專生。

1975年，醫(yī)事技術(shù)專修科改制為醫(yī)事技術(shù)學(xué)系。

1976年，設(shè)立臺北醫(yī)學(xué)大學(xué)附設(shè)醫(yī)院。

1977年，護理助產(chǎn)專修科改制為護理學(xué)系。

1979年，成立保健營養(yǎng)學(xué)系。

1989年，成立公共衛(wèi)生學(xué)系。

1989年，成立天然物醫(yī)學(xué)研究所。

1990年，胡俊弘先生接任校長，成立醫(yī)學(xué)研究所。

1992年，成立口腔復(fù)健醫(yī)學(xué)研究所。

1993年，口腔復(fù)健醫(yī)學(xué)研究所改名為牙醫(yī)學(xué)研究所。天然物醫(yī)學(xué)研究所改名為醫(yī)學(xué)研究所。

1994年，成立細胞及分子生物研究所。領(lǐng)先全國各校成立「醫(yī)學(xué)資訊暨電子計算機中心」。

1995年，成立保健營養(yǎng)學(xué)研究所碩士班。護理學(xué)研究所碩士班。

1996年，接收臺北市政府委托經(jīng)營市立萬芳醫(yī)院。

1997年，成立醫(yī)務(wù)管理學(xué)系。

1998年，成立生物醫(yī)學(xué)技術(shù)研究所、醫(yī)學(xué)資訊研究所。

1999年，成立生藥技術(shù)學(xué)系，是臺灣第一個中藥相關(guān)學(xué)系。由當時藥學(xué)院院長楊玲玲教授所創(chuàng)立,但由於藥師全聯(lián)會的反對,迫使2007年停止招生。

2000年，改名「臺北醫(yī)學(xué)大學(xué)」，成立醫(yī)務(wù)管理研究所、生物醫(yī)學(xué)材料研究所。

2001年，成立呼吸治療學(xué)系、口腔衛(wèi)生學(xué)系。

2002年，成立藥理學(xué)研究所、口腔科學(xué)研究所、保健營養(yǎng)研究所博士班。

2003年，通過衛(wèi)生署甄選，籌建雙和醫(yī)院，并成立醫(yī)學(xué)人文研究所。

2004年，成立神經(jīng)科學(xué)研究所。

2006年，口腔科學(xué)研究所與生醫(yī)材料研究所合并，改名為生醫(yī)材料暨工程研究所。護理學(xué)研究所博士班成立、醫(yī)事技術(shù)學(xué)系改名為醫(yī)學(xué)檢驗暨生物技術(shù)學(xué)系。

2007年，成立牙體技術(shù)學(xué)系、老人護理暨管理學(xué)系。由原先的醫(yī)學(xué)研究所基礎(chǔ)組、細胞及分子生物研究所、醫(yī)學(xué)檢驗暨生物技術(shù)學(xué)系碩士班、藥理學(xué)研究所及神經(jīng)科學(xué)研究所五所整合為醫(yī)學(xué)科學(xué)研究所。

2008年，附屬醫(yī)院-雙和醫(yī)院於7月1日開始營運、邱文達教授接任校長

2009年，醫(yī)務(wù)管理學(xué)系并入公共衛(wèi)生暨營養(yǎng)學(xué)院，開始招收碩士班國際學(xué)生。

2010年，成立醫(yī)學(xué)科技學(xué)院、人文暨社會科學(xué)院。

2011年，榮獲QS亞洲頂尖大學(xué)前百大。連續(xù)六年獲教育部補助近4億元。

2011年，邱文達校長榮陞衛(wèi)生署署長，閻云教授接任北醫(yī)第九任校長。

2013年，老人護理暨管理學(xué)系更名為高齡健康管理學(xué)系。

2014年，藥學(xué)系分設(shè)藥學(xué)組、臨床藥學(xué)組。

2015年，成立管理學(xué)院，并將公共衛(wèi)生暨營養(yǎng)學(xué)院中的「醫(yī)務(wù)管理學(xué)系（學(xué)士班、碩士班、碩士在職專班）」整并至管理學(xué)院。

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