漳縣珍稀水生動物國家級自然保護區地處秦嶺、青藏高原和黃土高原的交匯地帶,是三大地槽結構的交接處,具有明顯的地理過渡特征,是國家二級保護動物秦嶺細鱗鮭分布的最西界,裂腹魚類分布的最東北界,在淡水魚類地理分布格局方面具有一定的典型性。秦嶺細鱗鮭、水獺等多種珍稀水生動物在該區域已形成了穩定的生態種群。分布于保護區內渭河上游主要支流的秦嶺細鱗鮭,是世界上細鱗鮭屬在北半球自然分布的南界,是我國乃至世界上極為重要的處于自然狀態的山澗溪流水生生態系統,具有代表性和稀有性。
漳縣珍稀水生動物國家級自然保護區主要保護對象為國家Ⅱ級保護水生動物秦嶺細鱗鮭等。保護區位于漳縣漳河、龍川河、鐵鉤河、榜沙河等河流的山區,有大小支流20條,河流總長度274公里,總面積3775公頃,其中:核心區1485公頃,占保護區總面積的39.34%,長度148公里;緩沖區1240公頃,占32.85%,長度71公里;實驗區1050公頃,占27.81%,長度55公里,海拔1640-3941米。