“兜”的名字,是他在孤兒院時院長藥師野乃宇起的名字;“藥師”的姓氏則是繼承了野乃宇的姓氏。
“藥師”一詞源自傳說中的神祇藥師如來。傳說中的藥師如來能為信徒消除煩惱,免其受苦,消災延壽,滅除一切災劫病苦。另外,照字面意思,藥師的名字正顯示了其對藥物(兵糧丸、凝血丸)及醫術的精湛掌握,所以在漫畫中發現藥師兜使用過各種藥丸,以及高級的醫療忍術。
“兜”(カブト)是一種日本古代武士的頭盔。是兜初到孤兒院時,被院長隨口起的名字。大蛇丸安插在木葉的間諜三人組——藥師兜、赤胴鎧和劍美澄,他們名字里的“兜”(カブト)、“鎧”(ヨロイ)、“劍”(剣)都是武士的裝束,這些名字似乎表達了他們想要隱藏間諜的真面目這一點。
第三次忍者大戰時期,兜在不知父母及名字的狀況下被孤兒院院長藥師野乃宇收留,幼年時期就天資聰穎,但由于視力不佳,因此院長將自己的眼鏡送給兜,且兜也學會了醫療忍術,但在一次幫助木葉忍者療傷時初次遇見了還是木葉忍者的大蛇丸,因此被大蛇丸看了上眼。后來志村團藏連同大蛇丸和一名油女一族突然出現在孤兒院,要脅曾在諜報部有“行走的巫女”之稱、舊名藥師野乃宇的院長前去長期偵察巖忍者村是否有擬定大規模作戰計劃,團藏在查覺到在窗外偷聽的兜后,聲稱需要孩童成為木葉忍者來替補獲得這次情報犧牲的團藏部下,并以當次的補助金作為交換條件,成功將兜納入自己麾下。從此,兜被培訓成忍者間諜,在云、霧、砂、巖等其余國家的忍者村搜集情報,擅長偽裝自己的行蹤及氣息。五年后在巖忍者村待命的兜因為失誤遭遇襲擊,與他交戰重傷的敵方忍者竟然就是院長,試著呼叫她,但瀕臨死亡的院長不認得他,隨后兜被其他支援的敵方忍者逼退,迷惘的兜獨自一人到了河邊思考著自己為何會被最重要的人給遺忘,這時遇見大蛇丸,被帶至他的基地作為第一位訪客,隨后從大蛇丸口中得知團藏在他一離開孤兒院就向院長說出其實兜是為了他們的補助金而自我犧牲、加入了“根”,在院長的請求下團藏宣稱只要殺死某個人就會解放兜,而那個要殺死的人實際上就是“真正的兜”,原來一開始團藏為了避免兩人相遇把他們分配到不同地方執行任務,院長只能借由照片了解兜的成長過程和安全與否,而照片在中途被換成別人的照片,導致不知情的院長去殺害被她當成雙重間諜又試圖解救的兜本人,而大蛇丸原本是奉命要同時解決掉兜和院長,但是因為看上兜的才能而無意執行,在得知真相的兜決定接受大蛇丸邀請加入不隸屬任何國家的音忍者村,并利用大蛇丸為他捏造的身份重返木葉。
大蛇丸加入曉以后,讓兜假裝跟隨蝎。蝎以為兜被自己施了術以后,成了自己派去打入大蛇丸身邊的間諜,但蝎沒有想到的是,大蛇丸破解了他在兜身上施展的術,并反過來利用這一點刺探曉的情報。
初次出現于中忍選拔試會場內。當時他以木葉忍者村下忍的身份,前來參加考試,而且似乎是連續七次、共花了四年也沒考上中忍(至少兩次中途放棄),其實為了收集情報。他的隊友是赤銅鎧及劍美澄(實際上三人均是音忍者村的臥底)。一出場他便遇上了鳴人等九位新畢業的新人,并以熱情的態度,利用忍識卡為他們詳細解釋前來參加考試的考生類型、能力、原屬隱村及人數等。但當他談及音隱村時,似乎說了些輕視音隱村的說話,隨即遭到音忍托斯的攻擊。他自以為已避開托斯的攻擊,但孰料托斯使用的是音波攻擊,使他耳水不平衡、嘔吐及眼鏡碎裂(事后對大蛇丸透露自己先前不知道會有這些代表音隱村的忍者參賽,因此才會刻意隱藏實力試探他們)。后來第一場考試的考官森乃伊比基的出現,中止了音忍、藥師兜及鳴人他們之間的胡鬧。
到了第二場中忍考試──“死亡森林”臨近結束時,他遇上了有“地之卷軸”、但沒有“天之卷軸”(通過考試所需之兩卷軸)的鳴人他們。佐助得知兜已取得了“天之卷軸”及“地之卷軸”,就提出跟兜交戰的要求。但兜認為他們如若想取得“天之卷軸”,就更應該到終點塔之附近埋伏,因為那里有比較多的考生正趕赴終點。不過,兜亦指出那里也有其他跟他們相同想法、并在那里埋伏的考生,所以為了自身安全要和他們一同前往終點之塔。
就在差不多到了塔附近之時,遇上了來自雨隱村的下忍篝、夢多及朧。因這三名雨忍不擅長近身攻擊,所以他們使用了自己擅長的幻術及分身術,并把自己的真身隱藏起來。他們的目的就是想利用分身大量消耗鳴人、兜他們的體力,等鳴人他們的查克拉用盡后,便現身解決他們。兜在與分身的戰斗中,為了保護鳴人他們而被偷襲受傷。后雨忍三人的真身被發現,并被漩渦鳴人擊敗,成功取得“天之卷軸”。兜及鳴人四人順利到下一場考試的試場。
但就在中忍預賽考試前夕,他與隊友私下跟前來奪取佐助的大蛇丸會面,匯報了佐助的情況及表現。之后以受傷為由先行退出第三場考試的預賽,讓鳴人為他感到遺憾。然而事實上當時只有我愛羅能夠打敗擁有上忍實力的兜。
中忍選拔時退出后,就一直活躍于大蛇丸身邊,并跟砂之上忍葉鬼保持聯絡,開始音忍、砂忍聯手合攻打木葉隱村的準備。大蛇丸曾警告他不要做出違背目的的事,否則會殺死他(但后來戲說只是笑話),但他看著大蛇丸的未來容器──擁有寫輪眼的宇智波佐助就想到了自己,“太過優秀其實是很悲哀的”,因為這個想法,他趁佐助于醫院休息(因中了大蛇丸天之咒印而不適)時,打敗旗木卡卡西派來看守病房的四名暗部忍者,打算刺殺佐助,之后他似乎想用刀刺在佐助身上,但其實他是把刀拋向早已來到病房的旗木卡卡西。沒想到站在那里的“兜”其實是他以死魂之術令其中一位已故暗部忍者暫時復活并變成自己制造假像,而自己則變身成暗部倒在地上,到適當時機便跳窗而逃,卡卡西亦表示面對兜未必能擊倒他。
在第三場正式考試開始時,化裝成暗部并出現于會場。他醫治了當時身有內傷的日向雛田,但被犬冢牙的忍犬赤丸識破了身份,因此立即把牙及赤丸擊暈。及后當大蛇丸開始行動時,他便以幻術·涅盤精舍之術使會場所有人陷入深沉的睡眠,然后跟觀眾席內隱藏的音忍及砂忍一起行動。他的身份亦很快被卡卡西揭穿,當大蛇丸的行動失敗、雙手被三代目火影廢去后,兜跟砂隱村的葉鬼一同離去。
木葉隱村之戰后,砂隱村亦向木葉隱村投降。此時大蛇丸的雙手被三代的尸鬼封盡廢去,不但要面對難以忍受的痛楚,而且也使不出忍術。作為大蛇丸身邊的心腹及醫療忍者,他特制各種藥物,但只能稍減大蛇丸的痛楚。最后決定一起前往尋找“傳說三忍”之一、擁有高超醫療忍術的綱手,讓她治療大蛇丸的雙手。后來他們在短冊街的城堡處找到了綱手。大蛇丸向綱手提出條件,只要她肯答應醫治,就可以把她重要的人──斷及繩樹進行復活,以及不會摧毀木葉隱村為條件。綱手盡管很想見到親人,但她知道大蛇丸是不會輕易放過摧毀木葉隱村的機會,便假裝肯醫治大蛇丸,然后對他施以偷襲。兜看出綱手的偷襲,立即擲出手里劍分開大蛇丸及綱手。綱手跟大蛇丸、藥師兜之戰瞬間展開。
兜認為在城堡的地方不利于跟具有怪力的綱手對戰,于是便把綱手誘至山丘處。跟綱手一路打到山丘后,他服下兵糧丸,并使出具攻擊力的醫療忍術,把查克拉注入綱手手及腹的肌肉中,并加以損傷。對于兜的高超醫療忍術及身手,綱手也感到吃力。后來更對綱手胸口施以一掌,使其難于呼吸。綱手亦報以其絕技──亂身沖,將查克拉化成電力注入兜體內,麻痹其神經系統,令兜不能自由活動。但憑兜的醫療知識,也很快就突破麻痹狀態,正想進行反擊;剛好也被趕到的自來也、靜音及鳴人擊退。
同時面對兩名傳說三忍-自來也及綱手,兜決定先麻痹綱手的攻擊,向她展示她最害怕的血液;頓時綱手全身顫抖、動也不能動,只能任人攻擊。兜也向鳴人揭露自己真實身分,嘲笑鳴人只是個無能的小鬼,沒有當忍者的才能。被兜挑釁的鳴人,自然不會放過兜。鳴人以多重影分身術攻擊兜,但就如自來也所說,鳴人的實力和兜相差太遠,完全不到作用。因此,自來也決定自己來對付大蛇丸,讓靜音與兜對戰;另一方面,兜也協助大蛇丸召喚巨蛇。巨蛇襲向自來也他們,而兜襲擊帶著綱手逃離的靜音。兜躲過靜音的毒霧,然后從地中抓著并打斷靜音的腳筋,把她重摔在地上,并狂踢正于一旁顫抖的綱手。鳴人前來阻止,以護額擋住兜對綱手的拳打;但因大腿骨受傷、小腿伸直肌又被兜打斷,無法跟兜對戰,被兜不斷虐打,勸鳴人快放棄成為火影的夢想、舍棄同伴及逃走。盡管如此,以鳴人的強硬性格,依舊站在綱手面前保護她。鳴人約定要贏得綱手身上的項鏈、成為火影,奇跡地接下了兜的致命攻擊,并以剛學會的螺旋丸給兜重創一擊,傷及其內臟,連兜的醫療忍術也無法自愈。但兜在與鳴人接觸的一瞬間,已用查克拉手術刀把鳴人的心肌切斷,使鳴人在攻擊后亦不支倒地。兜以為鳴人死定了,綱手為鳴人流的眼淚,使她的精神亦被喚醒了、對血已不再害怕,并為鳴人賭上性命,利用創造再生自愈、又召喚出通靈獸蛞蝓。自來也也召喚出蛞蟆文太。兜見狀立即協助大蛇丸召喚通靈獸──萬蛇。一場混戰后,大蛇丸及萬蛇均被綱手、自來也聯手擊敗。兜立即救醒大蛇丸,并與大蛇丸一同撤退。
自三忍一戰后,兜正式退居幕后,在大蛇丸身邊服侍及為其醫療。因為大蛇丸雙手的痛楚日增,所以在宇智波佐助還未來到音隱村前,決定為大蛇丸挑選暫時的容器。他從牢中釋放了許多被囚禁的忍者,以放勝利者離開為理由,讓他們互相殘殺,最后只剩下一名忍者──幻幽丸。幻幽丸答應奉獻自己給大蛇丸作容器,以換取釋放其他被囚禁的伙伴,終亦成為大蛇丸的新容器。
除此之外,兜亦為音忍五人眾之一、擁有血繼限界──尸骨脈的君麻呂治療。君麻呂本是大蛇丸容器的選擇之一,但因身體本有惡疾,在暗殺風影后,已為大蛇丸所棄。他就是一直在兜的治療下生存著,直到他愿意協助把佐助帶來音隱村、離開兜的治療為止。兜此后在第一部已較少出現。