學院創建于1947年8月，前身為中央工委青年干部訓練班。70多年來，先后經歷了張家口軍委工程學校、北京電子?？茖W校、北京電子科技學院等發展時期。2003年，學院與西安電子科技大學開展聯合培養學術型碩士研究生。2011年，學院獨立開展碩士專業學位研究生培養試點工作。2018年，學院獲批碩士學位授予單位，同年，學院與中國科學技術大學、北京郵電大學聯合開展博士研究生教育。2021年，學院獲批博士學位授予單位。

截至2019年9月，學院現有4個系和2個教學部：密碼科學與技術系、網絡空間安全系、電子與通信工程系、密碼保密管理系、思想政治理論教學研究部和人文社會科學教學研究部。下設8個本科專業：信息安全、密碼科學與技術、電子信息工程、計算機科學與技術、通信工程、網絡空間安全、保密管理和行政管理。學院現有1個網絡空間安全一級學科博士學位授權點和3個碩士學位授權點:網絡空間安全、電子信息、公共管理（MPA），其中電子信息專業學位授權點包括新一代電子信息技術(含量子技術等)、通信工程(含寬帶網絡、移動通信等)、計算機技術等3個領域。同時，與中國科學技術大學、北京郵電大學聯合培養網絡空間安全學術型博士，與西安電子科技大學繼續聯合培養信息與通信工程、計算機科學與技術學術型碩士。

北京電子?？茖W校

1947年8月，北京電子科技學院的前身——中央工委青年訓練班在河北省平山縣西柏坡成立。并先后更名為南京機要學校、北京機要學校、宣化機要學校。

1981年，經國務院批準成立北京電子專科學校，校址設在小湯山。

1983年下半年，遷至半壁店，并正式對外公開招收大專生。

中南海業余大學

1948年，中央機關文化補習學校創建。毛澤東擔任名譽校長，劉少奇擔任第一任校長。

1954年，中央機關文化補習學校更名為中南海機關業余學校。后因故停辦。

1978年，十一屆三中全會后，由胡耀邦同志倡議恢復學校。

1981年，學校正式恢復。

1983年，中南海機關業余學校升格為中南海業余大學。

1988年，中南海業余大學參與合并組建首都聯合職工大學。

1993年，首都聯合職工大學（原中南海業余大學部分）改建為中南海業余大學。中央辦公廳決定將中南海業余大學并入北京電子科技學院，與之合署辦公。

北京電子科技學院

1992年，經國家教委批準，在北京電子?？茖W校的基礎上，建立北京電子科技學院，開始招收本科生，并增設函授教育。江澤民同志還為學院題寫了校名。

1999年2月，學校遷至豐臺新校園。

2003年，教育部批準學院與西安電子科技大學開展聯合培養密碼學碩士學位研究生工作。

2004年，開始與西安電子科技大學聯合招收全國統考碩士學位研究生；開始為西北六省區和新疆生產建設兵團開辦定向?？瓢?。

2011年1月19日，學院與西安電子科技大學簽訂了增補專業聯合培養碩士學位研究生協議，聯合培養學術性研究生學科在單一的密碼學基礎上增加通信與信息系統、計算機應用技術學科。10月17日通過了“服務國家特殊需求人才培養項目”試點工作審核，獲準在“電子與通信工程”、“計算機技術”兩個工程領域開展碩士專業學位研究生教育工作。

2012年，入選國家級大學生創新創業訓練計劃高校。

2018年3月，學校入選教育部國家級新工科研究與實踐項目。

以上信息源自官網，數據截止至2023年6月，請以官網為準！