| 序號 | 名稱 | 所在地區 | 旅游景區級別 | 自然保護區等級 |
|---|---|---|---|---|
| 武夷山 | 南平市 | 5A | 國家級(1979年建區) | |
| 龍棲山自然保護區 | 三明市 | 無 | 國家級(1984年建區) | |
| 君子峰自然保護區 | 三明市 | 無 | 國家級(1995年建區) | |
| 虎伯寮自然保護區 | 漳州市 | 無 | 國家級(1980年建區) | |
| 茫蕩山自然保護區 | 南平市 | 無 | 國家級(1987年建區) | |
| 汀江源自然保護區 | 龍巖市 | 無 | 國家級(2001年建區) | |
| 梅花山自然保護區 | 龍巖市 | 無 | 國家級(1985年建區) | |
| 梁野山自然保護區 | 龍巖市 | 無 | 國家級(1995年建區) | |
| 三明市建寧閩江源生態區 | 三明市 | 4A | 國家級(2000年建區) | |
| 雄江黃楮林自然保護區 | 福州市 | 無 | 國家級(1985年建區) | |
| 福建長樂閩江河口國家濕地公園 | 福州市 | 4A | 國家級(2003年建區) | |
| 峨嵋峰自然保護區 | 三明市 | 無 | 國家級(2001年建區) | |
| 漳江口紅樹林自然保護區 | 漳州市 | 無 | 國家級(1992年建區) | |
| 戴云山自然保護區 | 泉州市 | 無 | 國家級(1985年建區) | |
| 廈門珍稀海洋物種自然保護區 | 廈門市 | 無 | 國家級(1991年建區) | |
| 深滬灣海底古森林遺跡自然保護區 | 泉州市 | 無 | 國家級(1991年建區) | |
| 天寶巖自然保護區 | 三明市 | 無 | 國家級(1988年建區) |