1986年，從復旦大學生物系畢業，考入中國科學院昆明動物研究所就讀研究生。
1991年，獲得中國科學院昆明動物研究所博士學位后留所工作。
1992年，前往美國圣地亞哥動物協會做博士后研究。
1995年，回到中國科學院昆明動物研究所細胞與分子進化開放研究實驗室，擔任研究員、博士生導師、主任。
1999年，擔任云南省畜禽分子生物學重點實驗室主任。
2003年，當選為中國科學院院士。
2005年，擔任中國科學院昆明動物研究所所長。
2007年，當選為發展中國家科學院院士。
2008年，當選為云南省科學技術協會第七屆委員會主席。
2009年07月，被聘為昆明學院名譽院長。
2012年至今，擔任中國科學院副院長。
1996年，項目《獼猴屬的分子進化研究》獲得“云南省自然科學一等獎”。
1997年，項目《中國若干特有珍稀動物類群的細胞與分子進化研究》獲得“國家自然科學三等獎”。
2001年，項目《滇金絲猴生物學研究》獲得“云南省自然科學一等獎”。
2002年，獲得第三屆國際“生物多樣性領導獎”（第一位亞洲獲獎學者）。
2003年，項目《云南漢族系統性紅斑狼瘡與補體C4 C2基因相關性研究》獲得“云南省科技進步三等獎”。
2005年，項目《線粒體基因組多樣性與東亞人群歷史的研究》獲得“云南省自然科學一等獎”。
2005年，獲得“云南省科學技術突出貢獻獎”。
2006年，項目《線粒體基因組多樣性與東亞人群歷史的研究》獲得“國家自然科學二等獎”。
2009年，獲得第二屆“談家楨生命科學成就獎”。
2013年，項目《基因組多樣性與亞洲人群的演化》獲得“云南省自然科學特等獎”。
2014年，項目《基因組多樣性與亞洲人群的演化》獲得“國家自然科學獎二等獎”。
