1982年07月，畢業于復旦大學生物系，獲學士學位。
1990年12月，獲美國普渡大學生物化學系博士學位。
1990年12月－1992年11月，在美國普渡大學生物系、生物化學系從事博士后研究工作，任訪問講師。
1992年11月－1994年12月，任上海普洛麥格生物產品有限公司副研究員、生產經理。
1994年12月－1997年01月，任中國科學院上海植物生理研究所研究員、室主任、博士生導師、副所長。
1997年01月－1999年07月，任中國科學院上海生物工程研究中心研究員、室主任、博士生導師、主任。
2002年02月起，任中國科學院上海生命科學研究院植物生理生態研究所研究員、博士生導師，國家人類基因組南方研究中心執行主任，生物芯片上海國家工程研究中心主任。
2005年，當選為中國科學院院士。
2008年07月起，任香港中文大學微生物學系、李嘉誠健康科學研究所和威爾斯親王醫院教授。
2011年，當選為發展中國家科學院院士。
2014年，被普渡大學授予榮譽博士學位。
2001年，榮獲“上海科技進步二等獎”。
2002年，研究項目《遺傳性乳光牙本質致病基因的研究》榮獲“國家自然科學二等獎”。
2002年，榮獲“國家科技進步二等獎”、“上海科技進步一等獎”。
2005年，研究項目《廣東省傳染性非典型肺炎（SARS）防治研究》榮獲“國家科學技術進步獎二等獎”。
2005年，研究項目《鉤端螺旋體全基因組測序和部分功能的研究》榮獲“上海市科學技術進步獎”。
2006年，研究項目《SARS冠狀病毒分子進化及其相關流行病學規律的研究》榮獲“上海市自然科學獎一等獎”。
2008年，榮獲“上海市自然科學獎二等獎”。
