上海交通大學醫學院附屬第九人民醫院的前身“伯特利醫院”創建于1920年。1952年更名為上海第九人民醫院,1964年正式成為原上海第二醫學院附屬醫院,2005年上海第二醫科大學與上海交通大學合并,更名為上海交通大學醫學院附屬第九人民醫院。2014年11月,經上海市人民政府同意,上海交通大學醫學院附屬第九人民醫院與上海交通大學醫學院附屬第三人民醫院(前身寶鋼醫院,三級綜合性醫院)資源整合,統一布局,統一管理。2015年10月,上海市機構編制委員會批復市教委同意上海交通大學醫學院附屬第三人民醫院整建制并入上海交通大學醫學院附屬第九人民醫院。(以下簡稱“九院”)
九院是經上海市衛生局核準登記的政府主辦的非營利性三級甲等綜合性醫院。醫院有南部院區(制造局路639號)、北部院區(漠河路280號)、浦東院區(高科西路1908號)、浦東科教園區(錦尊路115號)和祝橋院區(云亭路99號)。醫院承擔本市區域基本醫療服務,主要從事急危重癥和疑難疾病的救治,是上海市120的定點醫院,上海市口腔干部保健醫療定點醫院。
九院總占地面積277.9畝,總建筑面積49.9萬平方米。總核定床位數2150張,口腔綜合椅位1000張。臨床科室64個,其中醫技科室11個。全院職工5160人。九院擁有5位中國工程院院士:著名整復外科專家張滌生教授、口腔頜面外科專家邱蔚六教授、骨科專家戴尅戎教授、口腔頜面頭頸腫瘤專家張志愿教授、眼眶病眼腫瘤專家范先群教授,醫院現已成為一所學科特色鮮明、具備一定臨床科技創新核心競爭力、國內知名的三級甲等綜合性醫院。
九院學科建設水平不斷發展。是國家口腔醫學中心和口腔疾病國家臨床醫學研究中心依托建設單位,醫院有口腔臨床醫學、整復外科、骨科等3個國家重點學科,口腔基礎醫學為國家重點培育學科。骨科、口腔頜面外科、牙體牙髓科、牙周病科、口腔修復科、眼科、整復外科、口腔正畸科、口腔黏膜病科、介入科、耳鼻咽喉頭頸外科等15個國家臨床重點專科;上海市臨床重點專科8個;上海市教委IV類“高峰學科”1項;上海市教委“高峰高原學科”建設項目1項。擁有口腔醫學、整復外科與組織工程學等3個教育部211工程重點學科;口腔病、整復外科、關節外科等3個上海市臨床醫學中心;上海市口腔疾病臨床醫學研究中心、上海市整形與修復重建臨床醫學研究中心等2個上海市臨床醫學研究中心;上海市口腔疾病研究中心、上海市眼部疾病研究中心、上海市聽覺與耳神經顱底外科研究中心、上海市整形外科研究中心、上海市骨科數字醫學研究中心等5個上海市重中之重研究中心。口腔黏膜病科列為國家中醫藥管理局重點專科、國家中西醫協同旗艦科室;血管外科為全國第一批外周血管介入診療培訓基地;組織工程學、口腔頜面外科學為上海市重點學科(優勢學科)、口腔修復和生物材料學為上海市重點學科(特色學科),口腔基礎醫學、眼科學為上海市重點學科;修復重建外科為上海市“重中之重”臨床醫學中心;康復醫學、急診與危重病學為上海衛生計生系統重要薄弱學科;中醫口腔黏膜病學為上海市中醫藥新興交叉學科。眼科、耳鼻喉科學為上海市“重中之重”臨床重點學科;內分泌科、麻醉科、泌尿外科為上海交通大學醫學院重點學科;醫院掛牌中國房顫中心,是上海交通大學血管病診治中心、疝與腹壁外科疾病診治中心單位,神經內科是上海市腦卒中預防與救治中心之一。